הלימודים בחוג מחולקים לשלושה שלבים: לימודי מבוא (סמסטר ראשון ללימודים); לימודי תשתית (סמסטר שני, שלישי ורביעי ללימודים) ולימודי העמקה (בשני הסמסטרים הבאים).

א. לימודי מבוא (סמסטר ראשון ללימודים):

• שיעור ראש החוג
• שני שיעורי חובה מבואיים
• סדנת חשיבה היסטורית 

ב. לימודי תשתית (סמסטר שני, שלישי ורביעי ללימודים)

• שו"תים (2 העוסקים בתקופה פרה-מודרנית, 2 בתקופות מודרניות ושו"ת נוסף לבחירה)
• שיעור חובה בפרק העת העתיקה (שנה א' בסמסטר ב')
• שיעורי בחירה
• שיעור בית הספר להיסטוריה (שיעור בחירה מאחד מחוגי בית הספר להיסטוריה: היסטוריה של המזרח התיכון ואפריקה ולימודי מזרח אסיה)

ג. לימודי העמקה (סמסטר חמישי עד שישי ללימודים)

• סמינריונים

 המסלול הדו-חוגי

התלמידים ישתתפו במהלך לימודיהם לתואר הראשון בשש מסגרות לימוד:

על כל תלמידי החוג להשלים לימודים בשפה זרה שנייה ברמת מתחילים.
הסטודנטים רשאים לבחור ללמוד שפה זרה שנייה ברמת "מתקדמים". אלה שיבחרו בזה וישיגו ציון חיובי בקורס, יזכו לפטור עם ציון של 4 ש"ס משיעורי הבחירה של החוג (מסגרת 120). סטודנט שנרשם לקורס שפה ולא השלים את הקורס או לא ביטל אותו בזמן, יחויב בשכר הלימוד עבור קורס השפה.