מכון כהן מציע בכל שנה מלגת בתר-דוקטורט. במהלך השנה, יכול מקבל המלגה לשלב בין עיסוק בתחומי המחקר שלו ואינטראקציות עם חברי הסגל והסטודנטים במכון. המלגה מוענקת על בסיס מצויינות אקדמית בתחום ההיסטוריה והפילוסופיה של המדע במובנו הרחב. מועמדים צריכים להיות בעלי דוקטורט ורקע מוכח של הישגים אקדמיים יוצאי דופן.
סכום המלגה הוא 18,000 דולר לשנה, וישנה אפשרות להאריך את המלגה לשנה נוספת באותם תנאים.
רשימה של מלגאי בתר-הדוקטורט במכון כהן בשנים האחרונות מופיעה כאן
הקול הקורא למלגאי בתר-דוקטורט לשנה האקדמית 2015-2016 התפרסם בתחילת פברואר 2015. לצפיה 
למידע נוסף בנוגע למלגות בתר דוקטורט ניתן לפנות למנהל המכון דרך ענת ציון: כתובת דוא"ל זו מוגנת מפני spambots, יש לאפשר JavaScript על-מנת לראות את הכתובת